En linux los antivirus son muy poco utilizados porque existen pocos virus que afecten al sistema operativo.
Respecto a la instalación de programas, no es necesario que sepas a dónde fueron a parar los archivos para que los puedas usar. Por ejemplo, si quisieras instalar el juego "OpenArena", vas al menú y abres el "Gestor de Programas" y ahí buscas el juego con ese nombre, le das al botón "instalar" y cuando termine de hacerlo cierras el "Gestor de Programas" y en el menú, bajo el ítem "Juegos" te aparecerá "OpenArena".
Como eres muy nuevo en linux te aconsejo que leas el manual de Linux Mint:
http://www.linuxmint.com/documentation/ ... sh_9.0.pdfEs para una versión más vieja de Mint, pero la mayoría de las explicaciones siguen siendo válidas.