Hola raiguar yo te recomiendo lo siguiente:
Reinstalar Linux Mint nuevamente, particionando de la siguiente forma: tienes que crear tres particiones, 1 "/" para el sistema, que correspondería a "C" de windows. Otra "/home" esta sería "D" de windows. y otra swap o de intercambio. Paso a detallarte el porqué de cada una:
Comienzas la instalación y cuando llegas al particionado eliges "manual" o "a mededa" no recuerdo como se llama la opción, pero es la última. Borras las particiones que tengas, incluidas las de windows (teniendo la precaución de hacer copia de seguridad de lo que quieras conservar).
Como no dices la capacidad de tu disco duro, supongamos que tiene 200 gb. le particionaríamos de la siguiente forma:
"/" particion raíz. Utilizarías 20 Gb; es la partición donde instalarías los archivos del sistema
"/home". La partición de usuario; es la partición donde se instalan y archiva todo lo relacionado con el usuario y sus configuraciones, además de tus archivos personales. 178 Gb
Swap o partición de intercambio, 1 Gb
Esta sería la configuración ideal. Ahora en caso de que por algún motivo tuvieras que reinstalar Mint, tan solo tendrías que formatear la partición raíz "/" y nunca la partición de usuario "/home" así de esta forma reistalarias el sistema y guardarías tus configuraciónes y archivos personales y no perderías nada.
Un saludo y me cuentas
Milord: Moderador de http://www.linuxmint-hispano.com